DÉPARTEMENT DE RECHERCHE CLINIQUE et D'INFORMATION MÉDICALE
Simone Mathoulin-Pélissier coordonnateur, Alain Monnereau
Le département (1-Information médicale et surveillance épidémiologique, et 2-Recherche et épidémiologie cliniques) est composé de 2,5 ETP de médecins, 2,5 ETP cadre et de 23 ETP CDI non médicaux ; par ailleurs pour les essais cliniques 3 ETP sont détachés dans l’unité (2 infirmières et un technicien de pathologie). Le département est localisé sur plusieurs sites (Bâtiment Tribondeau ; Parvis de l’Argonne ; Bâtiment des consultations). En 2010, les deux unités ont continué de développer leurs activités de routine et scientifiques, notamment par l’animation d’un axe cancer dans le centre Inserm U897 (Cf. activité du groupe Epidémiologie et Santé Publique). Un premier document sur la gestion des compétences a été mis en application pour la recherche clinique ; ce document devra évoluer et englober l’ensemble de l’activité du DRIM.
Sommaire
• Information Médicale et Surveillance Épidémiologique• Recherche et Épidémiologie Cliniques
• Archives
Information Médicale et Surveillance Épidémiologique
Alain Monnerau, Anne Jaffré, Marie-Laure Campo
Présentation
Les deux missions principales de cette unité sont l’information médicale avec des activités de gestion du dossier médical et du PMSI d’une part, et la surveillance épidémiologique avec l’enquête permanente cancer et le registre des hémopathies malignes de la Gironde d’autre part. L’année 2010 a permis de mettre en place la nouvelle organisation de l’Unité pour le projet de renouvellement du dossier médical informatisé : un médecin chef de projet coordonne les travaux du groupe projet (Anne Jaffré) et un autre médecin coordonne le Comité de Pilotage du schéma directeur du système d’information, instance d’aide à la décision de la Direction en matière d’information médicale (Alain Monnereau).
Information Médicale
Gestion du dossier médical et archives
Le projet phare en matière d’information médicale est celui de l’acquisition et le déploiement du nouveau dossier patient informatisé. L’année 2010 a été consacrée en grande partie à la sélection du fournisseur parmi les trois éditeurs référencés au niveau national mais également à la préparation de ce projet en interne. Entre juin et septembre des auditions ont été organisées pour identifier au mieux celui qui s’adaptait au mieux à notre existant. Puis dans le dernier trimestre de l’année 2010, un travail de cadrage et de préparation de projet a été réalisé par le groupe projet à l’aide d’une assistance à la maîtrise d’ouvrage. Plusieurs thèmes de travail ont été abordés pour anticiper le déploiement du futur progiciel : l’analyse de l’existant et des processus métiers ; l’étude d’impact du déploiement du nouveau dossier ; la problématique de reprise de données ; la stratégie de déploiement et l’organisation du projet. Le choix final sera entériné à la fin du premier trimestre 2011 pour un déploiement sur environ deux ans.
Un autre projet important celui du DMP a fait également l’objet d’une dernière phase d’expérimentation en 2010 après une relance par la tutelle. Cette expérimentation nous a permis de faciliter la création des nouveaux DMP et d’être en capacité d’alimenter ce dossier avec des informations pertinentes pour la médecine de ville. Enfin, des actions de communication et d’évaluation ont été réalisées dans le domaine de l’identito-vigilance.
Concernant les archives médicales, les indicateurs principaux décrivant les transactions réalisées en 2010 sont les suivants :
- Nombre total de dossiers cliniques stockés : 233460 dont les 6429 nouveaux dossiers ouverts en 2010.
- Nombre de prêts : 98 075 se décomposant en trois activités :1) prêts pour venues des patients 85258, 2) prêts pour courrier et mises au point 11336, 3) prêt pour travaux scientifiques 1481.
- Mises à jour non éditées : 20 285.
- Nombre de dossiers radiologiques ouverts : 3012 et 5829 CD intégrés dans le PACS.
En résumé et par rapport à 2009, cette activité suit l’augmentation générale de l’activité clinique dont elle est le support : le stock de dossiers augmente, de même que le nombre de dossiers ouverts (+10%), l’activité de prêts pour prise en charge des patients est logiquement en augmentation (+5%). Seuls les prêts pour travaux scientifiques ont diminué de 5% par rapport à 2009 indiquant vraisemblablement une utilisation plus fréquente du dossier informatisé. Enfin, on note une stagnation du nombre de dossiers radiologiques ouverts alors que l’intégration de CD extérieurs est en considérable augmentation (+60%).
Programme de Médicalisation des Systèmes d’Information (PMSI) Le nombre d’hospitalisations (hospitalisation classique et hôpital de jour) continue toujours d’augmenter (+5,6% entre 2009 et 2010), représentant 5383 patients hospitalisés au moins une fois à l’Institut Bergonié (+9,1%). Cette augmentation se retrouve aussi bien en hospitalisation classique (+4,2%) qu’à l’hôpital de jour (+6,7%) comme le décrit le tableau 1. Bien que plus modeste, l’activité de radiothérapie a elle aussi augmenté de près de 2%.
L’augmentation des séjours de moins de 24 heures, amorcée l’année dernière se confirme puisqu’on passe de 1422 à 2182 séjours soit un accroissement de plus de 50%. Cette très forte augmentation est en partie expliquée par l’ouverture de l’unité ambulatoire en février 2010 et qui a réalisé 706 séjours. Elle témoigne, néanmoins, d’un véritable tournant vers une prise en charge de courte durée en cancérologie.
Ceci est confirmé par d’une part, la diminution des séjours de plus de 24 heures et notamment ceux compris entre 24 et 48 heures et, d’autre part, par l’augmentation du nombre de séjours en hôpital de jour (+6,7%). L’analyse en fonction du type de séjours met en évidence une augmentation très importante des séjours chirurgicaux (+14,8%) et plus modeste pour les séjours médicaux (+2,7%). Cette élévation est expliquée par l’ouverture de l’unité ambulatoire dont les activités principales cette année, étaient la radiologie interventionnelle, la pose de Siev et la chirurgie du sein.
Un autre projet important celui du DMP a fait également l’objet d’une dernière phase d’expérimentation en 2010 après une relance par la tutelle. Cette expérimentation nous a permis de faciliter la création des nouveaux DMP et d’être en capacité d’alimenter ce dossier avec des informations pertinentes pour la médecine de ville. Enfin, des actions de communication et d’évaluation ont été réalisées dans le domaine de l’identito-vigilance.
Concernant les archives médicales, les indicateurs principaux décrivant les transactions réalisées en 2010 sont les suivants :
- Nombre total de dossiers cliniques stockés : 233460 dont les 6429 nouveaux dossiers ouverts en 2010.
- Nombre de prêts : 98 075 se décomposant en trois activités :1) prêts pour venues des patients 85258, 2) prêts pour courrier et mises au point 11336, 3) prêt pour travaux scientifiques 1481.
- Mises à jour non éditées : 20 285.
- Nombre de dossiers radiologiques ouverts : 3012 et 5829 CD intégrés dans le PACS.
En résumé et par rapport à 2009, cette activité suit l’augmentation générale de l’activité clinique dont elle est le support : le stock de dossiers augmente, de même que le nombre de dossiers ouverts (+10%), l’activité de prêts pour prise en charge des patients est logiquement en augmentation (+5%). Seuls les prêts pour travaux scientifiques ont diminué de 5% par rapport à 2009 indiquant vraisemblablement une utilisation plus fréquente du dossier informatisé. Enfin, on note une stagnation du nombre de dossiers radiologiques ouverts alors que l’intégration de CD extérieurs est en considérable augmentation (+60%).
Programme de Médicalisation des Systèmes d’Information (PMSI) Le nombre d’hospitalisations (hospitalisation classique et hôpital de jour) continue toujours d’augmenter (+5,6% entre 2009 et 2010), représentant 5383 patients hospitalisés au moins une fois à l’Institut Bergonié (+9,1%). Cette augmentation se retrouve aussi bien en hospitalisation classique (+4,2%) qu’à l’hôpital de jour (+6,7%) comme le décrit le tableau 1. Bien que plus modeste, l’activité de radiothérapie a elle aussi augmenté de près de 2%.
L’augmentation des séjours de moins de 24 heures, amorcée l’année dernière se confirme puisqu’on passe de 1422 à 2182 séjours soit un accroissement de plus de 50%. Cette très forte augmentation est en partie expliquée par l’ouverture de l’unité ambulatoire en février 2010 et qui a réalisé 706 séjours. Elle témoigne, néanmoins, d’un véritable tournant vers une prise en charge de courte durée en cancérologie.
Ceci est confirmé par d’une part, la diminution des séjours de plus de 24 heures et notamment ceux compris entre 24 et 48 heures et, d’autre part, par l’augmentation du nombre de séjours en hôpital de jour (+6,7%). L’analyse en fonction du type de séjours met en évidence une augmentation très importante des séjours chirurgicaux (+14,8%) et plus modeste pour les séjours médicaux (+2,7%). Cette élévation est expliquée par l’ouverture de l’unité ambulatoire dont les activités principales cette année, étaient la radiologie interventionnelle, la pose de Siev et la chirurgie du sein.
Surveillance Épidémiologique
Enquête Permanente Cancer (EPC) et surveillance
Le registre hospitalier inclut tous les patients venus physiquement à l’Institut Bergonié quelle que soit leur origine géographique. En 2010, 6709 patients sont venus à l’Institut Bergonié ce qui représente une augmentation respectivement de 10% et 20% par rapport aux années 2009 et 2008. Parmi eux, 3752 étaient atteints de cancer (stable par rapport à 2009) et 72% d’entre eux étaient traités en partie ou complètement à l’Institut (proportion et nombre absolu en augmentation de 5% par rapport à l’an dernier). La proportion de patients venant pour un avis thérapeutique était par conséquent en légère diminution par rapport aux deux dernières années.
L’origine géographique des patients reste en grande partie régionale (78% des patients résident dans un département d’Aquitaine et 46% habitent en Gironde). Dix sept pour cent des patients proviennent de la région Poitou-Charentes, chiffre stable depuis deux ans. Notre système d’information utilise les données de l’EPC en interne comme en externe car c’est le seul système qui permet d’identifier et d’associer de façon exhaustive les nouveaux patients et les nouvelles tumeurs prises en charge dans notre établissement. Ce registre collecte également des données fiables sur le stade et le traitement réalisé. Cette base de données codée est interrogée quasiment quotidiennement pour identifier et créer une liste de patients éligibles pour des travaux scientifiques ou d’évaluation. L’EPC participe également à l’alimentation des registres de population mis en place en Gironde depuis quelques années (plus de 1000 nouveaux cas annuels) et plus récemment du registre créé en Poitou Charentes. Il sert aussi de source de cas pour d’autres registres de population qualifiés comme les registres de Martinique ou Guyane. Cet apport a été valorisé cette année dans une publication soumise à une revue scientifique.
Enfin, le recueil des données de suivi après traitement (pour tout patient traité à l’Institut) permet de réaliser les études de survie, facilite la réalisation des travaux de recherche clinique en mettant à jour le statut vital de chaque personne. En 2010, 8 808 lettres ont été adressées à cet effet et selon un protocole défini (soit +14% en deux ans). Le taux de réponse reste très élevé (> 90%) si l’on considère que les patients sont suivis régulièrement (tous les deux ans).
Registre des hémopathies malignes de la Gironde
Les faits marquant l’année 2010 au registre sont les suivants : 1) nous avons collecté deux années d’incidence 2007 et 2008 (soit plus de 1400 cas) pour améliorer la réactivité du registre et suivre les recommandations du plan cancer 2009-2013, 2) nous avons poursuivi notre implication forte et active dans des projets internationaux sur le thème de l’épidémiologie des hémopathies lymphoïdes donnant lieu à des publications, 3) Nous avons participé à la rédaction du programme de travail (InVS-INCa) en cours de redéfinition pour les années à venir (2011-2013). L’amélioration de la réactivité du registre était un enjeu très important ayant eu un impact fort sur l’équipe du registre. L’équipe renforcée et motivée a mené de front l’enregistrement de ces deux années malgré certaines difficultés d’accès aux sources.
Les taux d’incidence bruts et standardisés sur les populations mondiale et européenne sont exposés dans les tableaux ci-dessous, selon les principales hémopathies lymphoïdes et myéloïdes.
Durant cette seconde année du quadriennal (2009-2012), le registre s’est efforcé de développer ses travaux de recherche en répondant activement à des appels d’offre. La suite du travail sur l’épidémiologie étiologique (sujet de la thèse d’ A. Monnereau en 2008) s’est plus particulièrement orienté cette année vers la participation active au consortium international Interlymph en collaboration avec l’unité 754 (coordination d’une étude poolée sur la consommation d’alcool et les lymphomes de Hodgkin (2840 cas et 13000 témoins)). Les travaux de recherche continuent d’aborder préférentiellement l’épidémiologie des hémopathies lymphoïdes même si certains projets en cours en 2010 s’adressent également à d’autres hémopathies comme les leucémies myéloïdes chroniques (LMC). Enfin, les registres spécialisés en hématologie au sein du réseau national Francim ont décidé en 2010 de constituer un réseau pour répondre à des questions épidémiologiques sur les hémopathies malignes rares ou sur des questions non abordées. Le premier projet porte sur l’étude des lymphomes du manteau. La synthèse de ces travaux est consultable sur notre site internet : http://etudes.isped.u-bordeaux2.fr/registres-cancers-aquitaine/Hm/H_Accueil.aspx
L’origine géographique des patients reste en grande partie régionale (78% des patients résident dans un département d’Aquitaine et 46% habitent en Gironde). Dix sept pour cent des patients proviennent de la région Poitou-Charentes, chiffre stable depuis deux ans. Notre système d’information utilise les données de l’EPC en interne comme en externe car c’est le seul système qui permet d’identifier et d’associer de façon exhaustive les nouveaux patients et les nouvelles tumeurs prises en charge dans notre établissement. Ce registre collecte également des données fiables sur le stade et le traitement réalisé. Cette base de données codée est interrogée quasiment quotidiennement pour identifier et créer une liste de patients éligibles pour des travaux scientifiques ou d’évaluation. L’EPC participe également à l’alimentation des registres de population mis en place en Gironde depuis quelques années (plus de 1000 nouveaux cas annuels) et plus récemment du registre créé en Poitou Charentes. Il sert aussi de source de cas pour d’autres registres de population qualifiés comme les registres de Martinique ou Guyane. Cet apport a été valorisé cette année dans une publication soumise à une revue scientifique.
Enfin, le recueil des données de suivi après traitement (pour tout patient traité à l’Institut) permet de réaliser les études de survie, facilite la réalisation des travaux de recherche clinique en mettant à jour le statut vital de chaque personne. En 2010, 8 808 lettres ont été adressées à cet effet et selon un protocole défini (soit +14% en deux ans). Le taux de réponse reste très élevé (> 90%) si l’on considère que les patients sont suivis régulièrement (tous les deux ans).
Registre des hémopathies malignes de la Gironde
Les faits marquant l’année 2010 au registre sont les suivants : 1) nous avons collecté deux années d’incidence 2007 et 2008 (soit plus de 1400 cas) pour améliorer la réactivité du registre et suivre les recommandations du plan cancer 2009-2013, 2) nous avons poursuivi notre implication forte et active dans des projets internationaux sur le thème de l’épidémiologie des hémopathies lymphoïdes donnant lieu à des publications, 3) Nous avons participé à la rédaction du programme de travail (InVS-INCa) en cours de redéfinition pour les années à venir (2011-2013). L’amélioration de la réactivité du registre était un enjeu très important ayant eu un impact fort sur l’équipe du registre. L’équipe renforcée et motivée a mené de front l’enregistrement de ces deux années malgré certaines difficultés d’accès aux sources.
Les taux d’incidence bruts et standardisés sur les populations mondiale et européenne sont exposés dans les tableaux ci-dessous, selon les principales hémopathies lymphoïdes et myéloïdes.
Durant cette seconde année du quadriennal (2009-2012), le registre s’est efforcé de développer ses travaux de recherche en répondant activement à des appels d’offre. La suite du travail sur l’épidémiologie étiologique (sujet de la thèse d’ A. Monnereau en 2008) s’est plus particulièrement orienté cette année vers la participation active au consortium international Interlymph en collaboration avec l’unité 754 (coordination d’une étude poolée sur la consommation d’alcool et les lymphomes de Hodgkin (2840 cas et 13000 témoins)). Les travaux de recherche continuent d’aborder préférentiellement l’épidémiologie des hémopathies lymphoïdes même si certains projets en cours en 2010 s’adressent également à d’autres hémopathies comme les leucémies myéloïdes chroniques (LMC). Enfin, les registres spécialisés en hématologie au sein du réseau national Francim ont décidé en 2010 de constituer un réseau pour répondre à des questions épidémiologiques sur les hémopathies malignes rares ou sur des questions non abordées. Le premier projet porte sur l’étude des lymphomes du manteau. La synthèse de ces travaux est consultable sur notre site internet : http://etudes.isped.u-bordeaux2.fr/registres-cancers-aquitaine/Hm/H_Accueil.aspx
Recherche et Épidémiologie Cliniques
S. Mathoulin-Pelissier
Sommaire
• Présentation• Activités liées à l'inclusion de patients dans des études cliniques
• Activités de soutien méthodologique, de traitement et d'analyse
• Activités au niveau régional
• Activités au niveau national et international
Présentation
L’unité composée d’attachés de recherche cliniques (10 ETP), de statisticiens (2), de gestionnaires de base de données (1,5) et secrétariat (1) coordonne avec les services concernés le développement et la bonne réalisation des essais cliniques (2 ETP infirmières pour des lits dédiés au 4ème étage, 1 ETP technicien en pathologie pour la gestion de certains essais). Cette unité est partie prenante dans les équipes de recherche suivantes : Centre de Traitement des Données des essais cliniques (INCa 2007), Centre d’Investigation Clinique-Epidémiologie Clinique (CIC-EC7 axe cancer, Inserm, fin 2007) et participe à l’analyse de certains travaux de l’Unité Inserm Vinco.
Pour rappel, les indicateurs en recherche clinique et innovation (activité 2009) situaient le centre en 4ème position pour l’inclusion et 1ère position pour la promotion d’études. L’année 2010 a permis de développer de nouveaux travaux en épidémiologie et biostatistique suite à des appels d’offres de l’INCa obtenus (2) et a été marquée par l’analyse de nombreux essais cliniques. Enfin, l’unité a participé à l’appel d’offre « essais précoces de l’INCa » (Centre labélisé d’excellence) qui a permis d’obtenir un financement pour cette activité partagée (hospitalisation/lits dédiés ; UREC; pharmacie ; pathologie…).
Activités liées à l’inclusion de patients dans des études cliniques
En 2010, 833 patients ont été inclus dans des essais cliniques auxquels participe l’Institut (102 études avec inclusion) : soit pour lesquels l’Institut est promoteur (210 patients dans 18 études) soit pour lesquels un médecin de l’Institut participe (623 patients dans 84 études). Au total, 157 études étaient ouvertes aux inclusions toute ou une partie de l’année (42 ouvertes durant l’année et 51 fermées pendant l’année). Cette activité d’essais cliniques implique la participation du personnel de l’unité aux visites de mise en place (59), d’audits (5) ou de contrôle et validation de données sur le site (plus de 600).
• Soutien à la conception de protocoles d’essais et études cliniques (9 protocoles) et analyse sous forme de rapports pour des essais cliniques ou des projets de recherche (8 rapports dont 2 analyses intermédiaires) pour comité de pilotage ou comité indépendant.
• Coordination méthodologique et gestion de bases pour 25 études de recherche biomédicale dont 3 déclarations CCTIRS et CNIL (hors champs MR001) ; maintenance ou élaboration de 23 formulaires électroniques (dont 8 initiés ou modifiés en 2010) pour les essais cliniques avec possibilité de saisie via des sites délocalisés et gestion de randomisation via internet (15 études dont 5 nouvelles et 1042 patients).
• Analyses pour des articles en cours ou soumis dans l’année (15), résumés et posters (32), thèses (11) ou mémoires (2 mémoires de master recherche)
• 15 publications par ou avec l’un des membres de l’équipe
• Gestion et exploitation de la base des essais cliniques et des bases de données prospectives, qui comportent le descriptif des malades ; des cancers avec stade et histologie ; des traitements ; de la surveillance. En 2010, ces bases ont permis de 1) réaliser des études pronostiques (n=5); 2) de mieux évaluer la prise en charge des patients (n=7); 3) de savoir combien de patients peuvent être inclus dans des études cliniques (screening); 4) de tester des modèles statistiques (n=2); 5) d’évaluer l’apport des méthodes génomiques dans la classification des tumeurs ou la définition du pronostic (n=4).
• Enseignement (Université Bordeaux 2) : 1) masters : master 1 de santé publique et master 2 Recherche et Professionnel d'Épidémiologie et Evaluation des actions de santé 2) Diplôme Inter-Universitaires : DIU européen de Pratiques Chirurgicales en Cancérologie et DIU Oncogériatrie (Université de Bordeaux) 3) Ecole d’été Institut Santé Publique Epidémiologie et Développement, module cancer 4) DESC cancérologie et DESC Cancérologie option Réseau
• Coordination de l’axe cancer du CIC-EC 7 (Cf rapport activité Groupe Epidémiologie et Santé publique) et participation au conseil scientifique de l’unité Inserm U897, Centre de Recherche « Epidémiologie et Biostatistique »
• Coordination et Animation de l’axe 5, Epidémiologie et Sciences Humaines et Sociales (modélisation des facteurs de risque) dans le Cancéropôle du Grand Sud-Ouest (GSO).
Activités liées au Centre de Traitement de Données : plate-forme pour les essais cliniques académiques
• Co-rédaction de demandes de Programme Hospitalier de Recherche Clinique (2)
• Elaboration de séminaires et d’expertises pour le Centre de Traitement de Données en partenariat avec l’Unité de soutien méthodologique à la recherche clinique du CHU (Cf. Rapport d’activité Centre de Traitement de données des essais cliniques).
• Statisticien référent groupe BECT-ORL de la FNCLCC.
Activités liées au CIC-EC cancer : Plate-forme pour les études de cohortes (Cf. Rapport activité du groupe Epidémiologie et Santé publique)
• Gestion et exploitation de la base Sarcomes et Gist (9133 dans la Conticabase + 1072 dans la ConticaGist dont 750 nouveaux cas) ; projet de recherche financé dans le cadre du réseau européen CONTICANET (Cf. Recherche en Pathologie) • Enregistrement commun (CHU de Bordeaux et Institut Bergonié) des données cliniques et biologiques des patients atteints de leucémie myéloïde chronique (513 patients).
• Co-coordination du projet DATECAN (Ligue nationale contre le cancer): définition des termes utilisés dans les critères de survie des essais cliniques en cancérologie (projet CIC-EC et CTD) et développement pour les sarcomes.
• Coordination du projet PREDYC (Appel d’offre Libre de l’INCa 2010): Development of dynamic prediction tools for cancer progression using joint modelling of time-to-event outcomes and longitudinal marker data.
• Coordination du projet SES-Sein (Appel d’offre Libre de l’INCa 2010): Facteurs socio-économiques, prise en charge thérapeutique et survie après un diagnostic de cancer du sein.
Autres activités :
• Collaboration et analyses pour des projets de recherche de biologie/génomique dans le cadre de l’unité inserm Vinco (organe : sarcome et sein)
• Suivi du développement d’un CRF électronique pour la gestion des patients dans les essais cliniques et d’un outil Internet de randomisation des patients (TenAlea avec le Netherlands Kaanker Institut) : 10 études pour des centres extérieurs.
• Participation aux groupes des statisticiens de la FNCLCC, groupe des datamanagers et au Réseau français des unités d’essais cliniques (réunions, formation) ; membre du groupe de travail à l’INCa Centre de traitement des données ; membre du conseil scientifique OPTIMON
Vue complète (chiffres Activité) de l'année en cours (PDF) : cliquer ici
Activités de soutien méthodologique, de traitement et d'analyse
• Soutien à la conception de protocoles d’essais et études cliniques (9 protocoles) et analyse sous forme de rapports pour des essais cliniques ou des projets de recherche (8 rapports dont 2 analyses intermédiaires) pour comité de pilotage ou comité indépendant. • Coordination méthodologique et gestion de bases pour 25 études de recherche biomédicale dont 3 déclarations CCTIRS et CNIL (hors champs MR001) ; maintenance ou élaboration de 23 formulaires électroniques (dont 8 initiés ou modifiés en 2010) pour les essais cliniques avec possibilité de saisie via des sites délocalisés et gestion de randomisation via internet (15 études dont 5 nouvelles et 1042 patients).
• Analyses pour des articles en cours ou soumis dans l’année (15), résumés et posters (32), thèses (11) ou mémoires (2 mémoires de master recherche)
• 15 publications par ou avec l’un des membres de l’équipe
• Gestion et exploitation de la base des essais cliniques et des bases de données prospectives, qui comportent le descriptif des malades ; des cancers avec stade et histologie ; des traitements ; de la surveillance. En 2010, ces bases ont permis de 1) réaliser des études pronostiques (n=5); 2) de mieux évaluer la prise en charge des patients (n=7); 3) de savoir combien de patients peuvent être inclus dans des études cliniques (screening); 4) de tester des modèles statistiques (n=2); 5) d’évaluer l’apport des méthodes génomiques dans la classification des tumeurs ou la définition du pronostic (n=4).
Activités au niveau régional
• Coordination de l’axe cancer du CIC-EC 7 (Cf rapport activité Groupe Epidémiologie et Santé publique) et participation au conseil scientifique de l’unité Inserm U897, Centre de Recherche « Epidémiologie et Biostatistique »
• Coordination et Animation de l’axe 5, Epidémiologie et Sciences Humaines et Sociales (modélisation des facteurs de risque) dans le Cancéropôle du Grand Sud-Ouest (GSO).
Activités au niveau national et international
Activités liées au Centre de Traitement de Données : plate-forme pour les essais cliniques académiques • Co-rédaction de demandes de Programme Hospitalier de Recherche Clinique (2)
• Elaboration de séminaires et d’expertises pour le Centre de Traitement de Données en partenariat avec l’Unité de soutien méthodologique à la recherche clinique du CHU (Cf. Rapport d’activité Centre de Traitement de données des essais cliniques).
• Statisticien référent groupe BECT-ORL de la FNCLCC.
Activités liées au CIC-EC cancer : Plate-forme pour les études de cohortes (Cf. Rapport activité du groupe Epidémiologie et Santé publique)
• Gestion et exploitation de la base Sarcomes et Gist (9133 dans la Conticabase + 1072 dans la ConticaGist dont 750 nouveaux cas) ; projet de recherche financé dans le cadre du réseau européen CONTICANET (Cf. Recherche en Pathologie) • Enregistrement commun (CHU de Bordeaux et Institut Bergonié) des données cliniques et biologiques des patients atteints de leucémie myéloïde chronique (513 patients).
• Co-coordination du projet DATECAN (Ligue nationale contre le cancer): définition des termes utilisés dans les critères de survie des essais cliniques en cancérologie (projet CIC-EC et CTD) et développement pour les sarcomes.
• Coordination du projet PREDYC (Appel d’offre Libre de l’INCa 2010): Development of dynamic prediction tools for cancer progression using joint modelling of time-to-event outcomes and longitudinal marker data.
• Coordination du projet SES-Sein (Appel d’offre Libre de l’INCa 2010): Facteurs socio-économiques, prise en charge thérapeutique et survie après un diagnostic de cancer du sein.
Autres activités :
• Collaboration et analyses pour des projets de recherche de biologie/génomique dans le cadre de l’unité inserm Vinco (organe : sarcome et sein)
• Suivi du développement d’un CRF électronique pour la gestion des patients dans les essais cliniques et d’un outil Internet de randomisation des patients (TenAlea avec le Netherlands Kaanker Institut) : 10 études pour des centres extérieurs.
• Participation aux groupes des statisticiens de la FNCLCC, groupe des datamanagers et au Réseau français des unités d’essais cliniques (réunions, formation) ; membre du groupe de travail à l’INCa Centre de traitement des données ; membre du conseil scientifique OPTIMON
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